MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Riemerella anatipestifer RA-GD chromosome

Total Repeats: 7224

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017569	TTA	2	6	3	8	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017569	TGT	2	6	51	56	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017569	TTG	3	9	57	65	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017569	TAAAAA	2	12	66	77	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017569	A	7	7	73	79	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017569	A	6	6	107	112	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017569	TATT	2	8	822	829	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017569	AAAG	2	8	842	849	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017569	TCT	2	6	877	882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017569	TTTTAA	2	12	1462	1473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017569	TAA	2	6	1507	1512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017569	A	6	6	1511	1516	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017569	T	6	6	2155	2160	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017569	A	7	7	2162	2168	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017569	AGT	2	6	5486	5491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017569	ATT	3	9	9474	9482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017569	A	7	7	9483	9489	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017569	TTTA	2	8	11023	11030	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017569	AATT	2	8	11073	11080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017569	ATTG	2	8	11092	11099	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017569	TAA	2	6	11133	11138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017569	ATTT	2	8	11149	11156	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017569	CAAT	2	8	12056	12063	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017569	T	6	6	12094	12099	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017569	ACAA	2	8	12120	12127	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017569	A	7	7	12167	12173	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017569	TAAATC	2	12	12982	12993	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_017569	ATT	2	6	12994	12999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017569	A	7	7	15223	15229	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017569	TAT	2	6	17481	17486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017569	A	6	6	17496	17501	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017569	TTTTA	2	10	19214	19223	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017569	TCA	2	6	19235	19240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017569	TGA	2	6	19249	19254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017569	T	7	7	19256	19262	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017569	T	6	6	19264	19269	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017569	TAT	2	6	19294	19299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017569	AGA	2	6	19317	19322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017569	TAA	2	6	19326	19331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017569	AAT	2	6	21660	21665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017569	TTAGAA	2	12	21666	21677	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017569	A	7	7	21716	21722	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017569	ATT	3	9	21727	21735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017569	TGG	2	6	21803	21808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017569	TGA	2	6	21819	21824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017569	A	7	7	21862	21868	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017569	ATTTA	2	10	22296	22305	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017569	A	7	7	22308	22314	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017569	AAG	2	6	22318	22323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017569	T	6	6	22336	22341	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017569	TA	3	6	22780	22785	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017569	A	6	6	22791	22796	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017569	T	6	6	22860	22865	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017569	CAA	2	6	23337	23342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017569	A	7	7	23351	23357	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017569	TTTA	2	8	23872	23879	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017569	T	6	6	23953	23958	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017569	TAAAT	2	10	23973	23982	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017569	TCC	2	6	24020	24025	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_017569	ATA	2	6	24071	24076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017569	GTA	2	6	24179	24184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017569	GGA	2	6	24185	24190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017569	TA	4	8	24207	24214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017569	TAA	2	6	24289	24294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017569	TTAC	2	8	24313	24320	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_017569	ATA	2	6	24322	24327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017569	CAT	2	6	24347	24352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017569	AAT	3	9	24368	24376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017569	A	6	6	24446	24451	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017569	TTTG	2	8	24656	24663	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017569	TAA	2	6	24673	24678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017569	CCA	2	6	24708	24713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_017569	CAC	2	6	24715	24720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_017569	ACA	2	6	24750	24755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017569	ATT	2	6	24881	24886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017569	AAT	2	6	26315	26320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017569	AAAG	2	8	26331	26338	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017569	TAA	2	6	26821	26826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017569	T	7	7	26834	26840	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017569	T	6	6	26845	26850	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017569	AAT	2	6	26962	26967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017569	T	6	6	26994	26999	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017569	T	6	6	27012	27017	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017569	GAT	2	6	27241	27246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017569	ATT	2	6	27263	27268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017569	TAA	2	6	27346	27351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017569	TGAT	2	8	28573	28580	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017569	AAT	3	9	28595	28603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017569	A	6	6	28667	28672	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017569	TAA	2	6	29326	29331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017569	T	6	6	29359	29364	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017569	ATA	2	6	29385	29390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017569	TC	3	6	29957	29962	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_017569	TCA	2	6	29992	29997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017569	A	6	6	29997	30002	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017569	AT	3	6	30014	30019	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017569	T	7	7	33547	33553	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017569	AAT	2	6	33569	33574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017569	AAAAGA	2	12	33592	33603	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017569	ATC	2	6	33636	33641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017569	TTC	2	6	33679	33684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017569	ATTT	2	8	33778	33785	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017569	AACC	2	8	33811	33818	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_017569	ATTT	2	8	33874	33881	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017569	AAT	2	6	33885	33890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017569	T	6	6	33920	33925	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017569	CTT	2	6	33932	33937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017569	TCC	2	6	33994	33999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_017569	TAC	2	6	34043	34048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017569	TCC	2	6	34053	34058	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_017569	TTGTTC	2	12	34090	34101	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_017569	AAAC	3	12	34121	34132	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_017569	TCA	2	6	34171	34176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017569	TTAT	2	8	34192	34199	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017569	T	6	6	35051	35056	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017569	TAT	2	6	36027	36032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017569	T	6	6	36032	36037	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017569	T	7	7	36095	36101	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017569	TAAAC	2	10	36151	36160	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_017569	AGT	2	6	43290	43295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017569	TA	3	6	43327	43332	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017569	A	6	6	43332	43337	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017569	ATC	2	6	43416	43421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_017569	GT	3	6	43451	43456	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017569	TACC	2	8	43535	43542	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_017569	TCC	2	6	43557	43562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_017569	GTG	2	6	43711	43716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017569	TTA	2	6	43780	43785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017569	CAT	2	6	43802	43807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_017569	CCA	2	6	43813	43818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_017569	ATC	2	6	43854	43859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017569	TGAT	2	8	43950	43957	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017569	TAT	2	6	44003	44008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017569	CGAA	2	8	44031	44038	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_017569	AGTA	2	8	44063	44070	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017569	AATC	2	8	44096	44103	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_017569	CCTT	2	8	44128	44135	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_017569	CTA	2	6	44150	44155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_017569	AGT	2	6	44186	44191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017569	CTC	2	6	44217	44222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_017569	A	7	7	44230	44236	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017569	AGA	2	6	44255	44260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017569	AT	3	6	44262	44267	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017569	CAG	2	6	44310	44315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_017569	TGC	2	6	44341	44346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_017569	CCT	2	6	44402	44407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
147	NC_017569	TCCTAA	2	12	44497	44508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_017569	AGT	2	6	44510	44515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017569	T	7	7	44515	44521	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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441	NC_017569	TAT	3	9	110842	110850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
442	NC_017569	ATC	2	6	110888	110893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
443	NC_017569	TTC	2	6	111020	111025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
444	NC_017569	TCT	2	6	111070	111075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
445	NC_017569	ATA	2	6	111101	111106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
446	NC_017569	ATCT	2	8	111134	111141	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
447	NC_017569	AAT	2	6	111146	111151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
448	NC_017569	TCT	2	6	111207	111212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
449	NC_017569	CCG	2	6	111256	111261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
450	NC_017569	GTT	2	6	111359	111364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
451	NC_017569	CT	4	8	111482	111489	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
452	NC_017569	CTG	2	6	111514	111519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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455	NC_017569	AAG	2	6	111706	111711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
456	NC_017569	ATA	2	6	111716	111721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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458	NC_017569	TAA	2	6	111742	111747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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461	NC_017569	TCTT	2	8	111840	111847	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
462	NC_017569	T	6	6	111857	111862	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
463	NC_017569	AAG	2	6	112015	112020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
464	NC_017569	ATA	2	6	112056	112061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
465	NC_017569	ACC	2	6	112133	112138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
466	NC_017569	TAC	2	6	112196	112201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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468	NC_017569	TC	3	6	112247	112252	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
469	NC_017569	T	7	7	112285	112291	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
470	NC_017569	TTC	2	6	112406	112411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
471	NC_017569	TCT	2	6	112443	112448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
472	NC_017569	CTG	2	6	112522	112527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
473	NC_017569	TAT	2	6	112579	112584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
474	NC_017569	CTG	2	6	112694	112699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
475	NC_017569	ATTTAC	2	12	112721	112732	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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477	NC_017569	CAT	2	6	112774	112779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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479	NC_017569	ATAA	2	8	112813	112820	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
480	NC_017569	TCT	2	6	112962	112967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
481	NC_017569	AT	3	6	113020	113025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
482	NC_017569	ATG	2	6	113045	113050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
483	NC_017569	ATA	2	6	113087	113092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
484	NC_017569	TAG	2	6	113128	113133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
485	NC_017569	TCC	2	6	113159	113164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
486	NC_017569	ATA	2	6	113247	113252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
487	NC_017569	TGC	2	6	113285	113290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
488	NC_017569	ATA	2	6	113337	113342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
489	NC_017569	ACT	2	6	113372	113377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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499	NC_017569	TA	3	6	115947	115952	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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